佩恩作为火影忍者手游中的强力角色，掌握他的核心技能机制是玩好的关键。天道佩恩的万象天引是核心起手技能，短按能将敌人抓取到面前并固定，长按则会把敌人砸向地面，这个技能前摇短释放快，适合开局直接使用或者衔接连招。神罗天征作为主要输出技能，以自身为中心弹开周围敌人，配合万象天引能打出高额伤害，记住在墙角连招效果会更好。
饿鬼道佩恩的特殊机制在于技能命中或吸收攻击后会强化下一次技能，一技能饿鬼猛冲能向前冲出抓取敌人并吸收查克拉，二技能封术吸印可以形成无敌护盾吸收伤害。当触发强化状态时，技能威力和持续时间都会提升，但释放后就会回到普通状态，所以要把握好强化时机。奥义轮回尽封适合在斩杀时使用，能造成毁天灭地的伤害。
人间道佩恩的技能设计很有特色，普攻第五段有击飞效果适合连招，一技能回月轮分为短按和长按两种形态，命中后能追加斩击。二技能穿尘击同样有长短按区别，长按版本能抓取对手蓄力撕裂，技能结束后还能观察对手技能冷却情况，这个机制在对战中非常实用。奥义轮回魂破明命中后也能查看对手技能冷却，未命中则没有后续表现。
百战佩恩的黑棒机制是最大亮点，普攻掷出的黑棒会留在场上最多5根，与一二技能有联动效果。一技能万象天引会根据场上黑棒数量产生不同效果，5根黑棒时命中敌人会有特殊视觉表现。二技能神罗天征有三段强化，配合黑棒能延长抓取时间，5根黑棒时甚至能让对手在第三段伤害前无法替身。组合技地爆天星需要先释放三段神罗天征再点击万象天引触发。
