顺利通关水牢关卡，首先要选择合适的忍者。推荐使用擅长水遁或综合能力强的忍者，比如漩涡鸣人、宇智波佐助或旗木卡卡西。这些忍者的技能可以有效应对水牢中的敌人，尤其是面对BOSS时，水遁忍术能造成更高伤害。同时要注意忍者的等级和装备，提前升级忍者和强化装备能大幅提升战斗力。
水牢中的敌人分为普通水忍者和岩忍者，他们会使用不同的遁术攻击。对付水忍者时多用火遁或雷遁，对付岩忍者则优先使用土遁或风遁。BOSS战阶段要留意他的水遁和岩遁连招，尤其是水柱和岩块攻击，及时躲避是关键。当BOSS血量较低时，抓住机会用奥义技能终结。
尽量把BOSS控制在场地中央，避免把他打到两侧水面，否则他会召唤水龙弹反击。如果看到绿色水泡飘过来，立刻远离，被水泡困住会让BOSS回血。队友被水泡困住时，可以用秘卷或技能打破水泡救人。战斗中多利用忍术组合，比如先用控制技能定住敌人，再接高伤害技能。
推荐携带熊猫通灵兽获得霸体效果，或者用蛞蝓通灵兽来回血。秘卷方面，禁术阴愈伤灭可以提供短暂霸体，风遁气旋能提升移速躲避技能。在BOSS释放大招前开霸体，或者在他召唤小怪时用通灵兽控场，都能让战斗更轻松。当BOSS血量降到一定程度时会召唤分身，优先清理分身再集火BOSS。如果战力较低，可以采用稳扎稳打的策略，多走位躲避技能，慢慢消耗BOSS血量。
